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概述

Artifactory本机支持R语言的CRAN存储库,使您能够完全控制CRAN包的部署和解析过程。综合R档案网络(CRAN)是一个包含相同材料的网站集合,包括R分发版、贡献的扩展、R文档和二进制文件。R是一种编程语言和自由软件环境,专门用于统计计算和图形,由统计计算R基金会支持。R语言被广泛使用用于开发统计软件和数据分析数据矿工和统计学家

Artifactory中的CRAN存储库提供了以下好处:

  • 具有细粒度访问控制的安全私有本地CRAN存储库。

  • 代理远程CRAN资源和缓存下载的CRAN包的能力,使您独立于网络和2022世界杯阿根廷预选赛赛程远程资源。

  • 虚拟CRAN存储库,支持单一URL,通过该URL管理所有CRAN包的解析和部署。

  • 承载在Artifactory本地存储库中的CRAN包的元数据计算。

  • 版本管理:将上传到本地存储库的包的旧版本存档。

  • 管理源代码和二进制文件。

CRAN版本支持

Artifactory支持CRAN 3.4.0及以上版本。

页面内容




配置

局部存储库

要启用CRAN元数据的计算,在Administration模块中,转到存储库|存储库|当地的并选择凹口随着包类型当您创建本地存储库时。

本地存储库布局

你需要维护特定的路径结构以便管理上传到CRAN本地存储库的CRAN包

CRAN包上传到以下位置:

  • 默认情况下,源包会自动上传到相对路径:src /普通发布版.例如:src / contrib / ArtifactoryRDS_0.1.0.tar.gz
  • 根据发行版和R版本,将二进制包上传到相对路径。例如:/ myfirstpkg_1.2.tgz。

Artifactory将通过执行属性搜索来查找包,从而使文件夹层次结构不会对性能产生影响。

将源包放在推荐的路径中

当通过UI上传CRAN包时,不强制使用默认部署路径,但建议使用默认部署路径,因为它允许Artifactory管理CRAN包。将这些包上传到不同的路径将导致这些包不能被识别为CRAN包。

远程存储库

您可以创建CRAN远程存储库来代理和缓存远程存储库或其他Artifactory实例。

注意,远程CRAN存储库的索引文件是根据检索缓存周期设置。


虚拟存储库

Artifactory中的虚拟存储库聚合来自本地和远程存储库的包。这允许您从为虚拟存储库定义的单个URL访问本地托管的CRAN包和远程代理的CRAN库。

若要创建虚拟CRAN存储库,请设置凹口随着包类型并选择底层本地和远程CRAN存储库包含在存储库部分。


解决CRAN包

在UI中解析CRAN包

当在Artifacts模块Tree Browser中选择CRAN存储库时,单击撮合我查看您可以用来发布CRAN包或配置您的R客户端以使用所选的解析工件的代码片段存储库

使用R命令行解析CRAN包

1.运行撮合我凹口。

2.到s从当前存储库切换到不同分辨率的CRAN存储库

setRepositories ()

3.查看所选C的所有可用包运行库。

available.packages ()

4.从CRAN存储库安装一个包。

install.packages() -在受支持的客户端上从列表中选择



部署CRAN包

方法可以将包部署到本地或虚拟CRAN存储库部署UI中的功能或者使用POST请求。

元数据更新

当添加、删除、复制或移动CRAN包时,会自动计算和更新CRAN元数据。计算只在与包相关的操作完成后调用。
有时可能需要30秒才能完成由于该进程是异步的,其性能取决于整个系统负载。
还可以通过选择在整个存储库上调用元数据计算重建索引包

设置默认部署存储库

若要将CRAN包部署到虚拟CRAN存储库,请确保已设置默认部署存储库


通过UI部署包

您可以在用户界面的“部署”中拖放或选择CRAN包上传。Artifactory将识别它是源包还是二进制包。

Artifactory支持两种类型的包:二进制文件和源代码。它们在UI中的部署方式不同。

部署源包

当部署源部署时,目标路径会自动显示,我们建议不改变这条路径改变了src /普通发布版路径将导致Artifactory不能识别该包为CRAN包,因为Artifactory将无法索引它。

目标路径

Target路径会自动更新,更改它可能会使Artifactory不调用元数据计算,并且这个包不会被索引。

部署二进制包

在二进制部署中,您需要填充CRAN Artifact部分。

在CRAN Artifact部分中,在部署CRAN包时配置这些字段。必须设置这些字段,并用于创建目标已部署二进制包的路径。

  • 分布:指定操作系统。
  • R版本:表示R版本使用。

目标路径

完成目标路径的更新该文件已经部署,不需要更改它

使用cURL部署包


部署源包
curl -XPOST "http://localhost:8080/artifactory/api/cran/cran-local/sources" -T package_1.0.tar.gz



部署二进制包
curl -XPOST "http://localhost:8080/artifactory/api/cran/cran-local/binaries?distribution=macosx/el-capitan&rVersion=3.5" -T package_1.0。-T package_1.0.zip

部署CRAN二进制包时,需要像以前一样指定发行版和R版本。

当直接部署(PUT请求到特定路径)时,确保目标路径是有效的CRAN路径:

  • / src /普通发布版的来源
  • /bin /{分布}/ contrib / {r-version}对二进制文件。

将包部署到不同的路径不会将包标识为CRAN包,也不会调用元数据索引。


在本地CRAN存储库上应用CRAN官方规范

从Artifactory版本7.41.1开始,您可以设置存储在本地CRAN储存库中的工件,以限制于官方CRAN规范需求。

设置以下内容系统属性。yml文件将您的CRAN档案保存在正确的层次结构中。

“cran.archiveMover.enabled”

您可以使用以下命令将现有的存档移动到正确的路径移动CRAN档案REST API。要求cran.archiveMover.enabled启用。添加链接


查看单个CRAN包信息


Artifactory允许您直接从UI查看CRAN包的选定元数据。

工件存储库浏览器选择您的虚拟CRAN存储库并向下滚动以查找和选择您想要检查的包。元数据显示在凹口信息选项卡。

重建CRAN存储库

您可以通过UI或使用REST API触发本地CRAN存储库的异步重建。

通过UI,在树浏览器中选择CRAN存储库,并从右键菜单中选择realculate Index,如下所示(需要Admin权限)

要通过REST API重新索引CRAN存储库,请参考计算CRAN存储库元数据

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