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概述

Artifactory原生支持R语言的CRAN存储库,让您完全控制CRAN包的部署和解析过程。R综合档案网络(CRAN)是一个站点的集合,这些站点携带相同的材料,包括R发行版、贡献的扩展、R文档和二进制文件。R是一种编程语言和免费软件环境,专门用于统计计算和图形,由R统计计算基金会支持。R语言被广泛使用用于开发统计软件和数据分析数据挖掘者和统计学家

Artifactory中的CRAN存储库提供了以下好处:

  • 具有细粒度访问控制的安全和私有本地CRAN存储库。

  • 代理远程CRAN资源和缓存下载的CRAN包的能力,使您独立于网络和2022世界杯阿根廷预选赛赛程远程资源。

  • 支持单个URL的虚拟CRAN存储库,通过该URL管理所有CRAN包的解析和部署。

  • 托管在Artifactory本地存储库中的CRAN包的元数据计算。

  • 版本管理:存档上传到本地存储库的包的旧版本。

  • 管理源代码和二进制文件。

CRAN版本支持

Artifactory支持CRAN 3.4.0及以上版本。

页面内容




配置

局部存储库

若要启用CRAN元数据的计算,在“管理”模块中,请转到存储库|存储库|当地的并选择凹口随着包类型当您创建本地存储库时。

本地存储库布局

你需要维护特定的路径结构以便管理上传到CRAN本地存储库的CRAN包

CRAN包被上传到以下位置:

  • 默认情况下,源包会自动上传到相对路径:src /普通发布版.例如:src / contrib / ArtifactoryRDS_0.1.0.tar.gz
  • 二进制包根据发行版和R版本上传到相对路径。例如:/ myfirstpkg_1.2.tgz。

Artifactory将通过执行属性搜索来查找包,从而使文件夹层次结构不会对性能产生影响。

将源包放置在推荐路径中

当通过UI上传CRAN包时,不强制使用默认部署路径,但推荐使用,因为它允许Artifactory管理CRAN包。将包上传到不同的路径将导致包不能被标识为CRAN包。

远程存储库

您可以创建CRAN远程存储库来代理和缓存远程存储库或其他Artifactory实例。

方法存储和更新远程CRAN存储库的索引文件检索缓存周期设置。


虚拟存储库

Artifactory中的虚拟存储库聚合来自本地和远程存储库的包。这允许您从为虚拟存储库定义的单个URL访问本地托管的CRAN包和远程代理CRAN库。

若要创建虚拟CRAN存储库,请设置凹口随着包类型的基础本地和远程CRAN存储库存储库部分。


解析CRAN包

在UI中解析CRAN包

当在Artifacts模块Tree Browser中选择CRAN存储库时,单击给我介绍查看可用于发布CRAN包或配置R客户端以使用所选选项解析工件的代码片段存储库

使用R命令行解析CRAN包

1.运行给我介绍凹口。

2.到s从当前存储库切换到不同分辨率的CRAN存储库

setRepositories ()

3.查看所选C . C .的所有可用包运行库。

available.packages ()

4.从CRAN存储库安装一个包。

install.packages() -从列表中选择,在支持的客户端上安装



部署CRAN包

可以将包部署到本地或虚拟CRAN存储库部署UI中的特性或者使用POST请求。

元数据更新

在添加、删除、复制或移动CRAN包时,会自动计算和更新CRAN元数据。计算只在与包相关的操作完成后调用。
有时可能需要30秒才能完成由于该进程是异步的,其性能取决于整个系统负载。
还可以通过选择在整个存储库上调用元数据计算重建索引包

设置默认部署存储库

若要将CRAN包部署到虚拟CRAN存储库,请确保已设置默认部署存储库


通过UI部署包

在用户界面的Deploy中可以拖放或选择要上传的CRAN包。Artifactory将识别它是源包还是二进制包。

Artifactory支持两种类型的包:二进制文件和源代码。就UI中的部署而言,它们被区别对待。

部署源包

在部署源部署时,将自动显示目标路径,我们建议不改变这条路径改变了src /普通发布版path将导致Artifactory不能将该包识别为CRAN包,因为Artifactory将无法索引它。

目标路径

Target路径会自动更新,更改它会使Artifactory不调用元数据计算,并且这个包不会被索引。

部署二进制包

在二进制部署中,您需要填写CRAN Artifact部分。

在CRAN Artifact部分中,部署CRAN包时配置这些字段。必须设置这些字段,并用于创建目标已部署二进制包的路径。

  • 分布:指定操作系统。
  • R Version:版本号R版本使用。

目标路径

完成目标路径的更新文件已部署,无需修改

使用cURL部署包


部署源包
curl -XPOST "http://localhost:8080/artifactory/api/cran/cran-local/sources" -T package_1.0.tar.gz



部署二进制包
curl -XPOST "http://localhost:8080/artifactory/api/cran/cran-local/binaries?distribution=macosx/el-capitan&rVersion=3.5" -T package_1.0。tgz curl -XPOST "http://localhost:8080/artifactory/api/cran/cran-local/binaries?distribution=windows&rVersion=3.5" -T package_1.0.zip

当部署CRAN二进制包时,您需要像以前一样指定发行版和R版本。

当直接部署(PUT请求到特定路径)时,确保目标路径是有效的CRAN路径:

  • / src /普通发布版的来源
  • /bin /{分布}/ contrib / {r-version}对二进制文件。

将包部署到不同的路径不会将该包标识为CRAN包,也不会调用元数据索引。


在本地CRAN存储库上应用CRAN官方规范

从Artifactory版本7.41.1开始,您可以将存储在本地CRAN存储库中的工件设置为仅限于官方CRAN规范需求。

设置以下内容系统属性。yml文件以保存您的CRAN档案在正确的层次结构。

“cran.archiveMover.enabled”

您可以使用以下方法将现有存档移动到正确的路径移动CRAN档案REST API。要求cran.archiveMover.enabled启用。添加链接


查看单个CRAN包信息


Artifactory允许您直接从UI查看选定的CRAN包元数据。

工件存储库浏览器选择您的虚拟CRAN存储库并向下滚动以找到并选择您想要检查的包。元数据显示在凹口信息选项卡。

重新建立一个CRAN存储库

您可以通过UI或REST API触发本地CRAN存储库的异步重新索引。

通过UI,在树浏览器中选择您的CRAN存储库,并从如下所示的右键菜单中选择重新计算索引(需要Admin权限)

要通过REST API重新索引CRAN存储库,请参考计算CRAN存储库元数据

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